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Nature Commun. | 中国农科院果树所发布高质量苹果基因组,并揭示反转录转座子和果实着色的关联性

 

  2019年4月2日,中国农业科学院果树研究所丛佩华研究员课题组在Nature Communications在线发表了题为A high-quality apple genome assembly reveals the association of a retrotransposon and red fruit colour的研究论文。该研究组装了来源于花药的苹果纯合系HFTH1的高质量基因组,并揭示了反转录转座子和红色果实颜色的关联性。

  

  与'金帅'参考基因组相比,该研究在HFTH1基因组中鉴定到了18,047个缺失,12,101个插入和14个大的倒位。 研究发现,这些基因组变异主要是由转座子引起的。 有意思的是,在花青素生物合成的关键转录因子MdMYB1上游有一个长末端重复(LTR)反转录转座子的插入,与红色果皮表型相关。

  

  Red phenotype of apple associated with an LTR retrotransposon

  总之,研究结果为苹果红色果实着色的分子机制提供了新的见解;该研究发布的高质量基因组为苹果重要农业性状的研究提供了重要基础。

 

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